大闸蟹含有丰富的蛋白质、脂肪和矿物质等营养物质。每100克螃蟹可食部分中含蛋白质17.5克，脂肪2.6克，胆固醇267毫克，钙126毫克，铁2.9毫克，锌3.68毫克，磷182毫克。大闸蟹中维生素A高于其它陆生及水生动物，维生素B2是一般肉类的5～6倍，比鱼类高出6～10倍，比蛋类高出2～3倍。维生素B1比一般鱼类高出6～10倍。

大闸蟹之所以如此鲜美，是因为其肉质富含谷氨酸、丙氨酸、甘氨酸等鲜味物质。大闸蟹的蟹黄（也被称为胰腺肝）是蟹用来储存营养和吸收养料的器官，其中大部分储存的都是脂类物质，游离脂肪酸是丰富的风味前体物质和滋味物质。因此，大闸蟹的独特风味，来自于多种呈味物质共同作用的结果。

大闸蟹富含各种矿物质，但同时，容易富集铅、镉、铬等重金属，那么大闸蟹中重金属含量会超标吗？根据中国水产科学研究院淡水渔业研究中心的多项评估显示，正常食用量下不存在食品安全风险。另外，正规养殖的大闸蟹安全性相对有所保证。即便如此，不建议购买来源不明的大闸蟹。

按照我国膳食指南的推荐，每天的鱼、禽、蛋、瘦肉的摄入量约120～200 克。换算成大闸蟹来说，如果身体健康、没什么特殊情况，每天可食用2只。大闸蟹属于高蛋白高胆固醇的食物，蛋白摄入过多容易造成消化系统负担，对于肠胃敏感或患有高血压、高血脂、高胆固醇、高尿酸血症的人群，建议慎吃。另外，蟹肉含丰富的蛋白质，极容易腐坏，一旦进食不新鲜的螃蟹，很可能中毒或感染细菌引起腹泻和高烧。死蟹体内会分解有毒的组胺，因此也不建议食用。